Génomique pour l'adaptation et la résilience au changement climatique (projet GenARCC)

Période de financement : 2022-2027
Responsables : James Macklin, AAC et Ian Bradbury, MPO
Investissement global de l'IRDG : 9 480 000 $

À l'échelle mondiale, les changements climatiques continuent d'entraîner de graves perturbations environnementales, les dernières années ayant été les plus chaudes jamais enregistrées au cours de la période industrialisée. Au Canada, le climat continue de se réchauffer à un rythme 2 fois supérieur à celui du réchauffement planétaire, le nord du Canada étant exposé aux changements les plus extrêmes. Il y a un besoin croissant d'avis scientifiques sur la réponse d'espèces clés aux changements climatiques, et les implications économiques et sociétales qui en découlent. Les changements climatiques représentent une priorité touchant les mandats de plusieurs ministères et organismes fédéraux à vocation scientifique. Soixante-trois chercheurs et leurs équipes utilisent la génomique pour évaluer les changements climatiques afin de protéger la biodiversité du Canada, la résilience des écosystèmes, la sécurité alimentaire et la santé. Ils quantifient la diversité génétique des espèces et des populations clés, en surveillant les changements associés au climat et en utilisant la génomique pour prédire les vulnérabilités futures des écosystèmes de la toundra, forestiers, aquatiques, côtiers et agricoles.

Faits saillants

  • 5 ans de collaboration
  • 63 scientifiques et leurs équipes
  • 8 ministères et organismes fédéraux

Objectif

Utiliser la génomique pour évaluer les changements climatiques afin de protéger la biodiversité du Canada, la résilience des écosystèmes, la sécurité alimentaire et la santé

Retombées prévues

  • Avis scientifiques sur la réponse d'espèces clés aux changements climatiques, et les implications économiques et sociétales qui en découlent
  • Diversité génétique quantifiée chez des espèces et populations clés
  • Utilisation de la génomique pour prédire les vulnérabilités futures des écosystèmes de la toundra, forestiers, aquatiques, côtiers et agricoles

Publications

  • Ahmed R, Nasheri N. 2023. Animal reservoirs for hepatitis E virus within the Paslahepevirus genus. Veterinary Microbiology. Vet Microbiol 278:109618. https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2022.109618 (en anglais seulement)
  • Alkie TN, Lopes S, Hisanaga T, Xu W, Suderman M, Koziuk J, Fisher M, Redford T, Lung O, Joseph T, Himsworth CG, Brown IH, Bowes V, Lewis NS, Berhane Y. 2022. A threat from both sides: Multiple Introductions of genetically distinct H5 HPAI viruses into Canada via both East Asia-Australasia/Pacific and Atlantic flyways. Virus Evolution 8(2). https://doi.org/10.1093/ve/veac077 (en anglais seulement)
  • Alkie TN, Cox S, Embury-Hyatt C, Stevens B, Pople N, Pybu MJs, Xu W, Hisanaga T, Suderman M, Koziuk J, Kruczkiewicz P, Nguyen HH, Fisher M, Lung O, Erdelyan CNG, Hochman O, Ojkic D, Yason C, Bravo-Araya M, Bourque L, Bollinger TK, Soos C, Giacinti J, Provencher J, Ogilvie S, Clark A, MacPhee R, Parsons GJ, Eaglesome H, Gilbert S, Saboraki K, Davis R, Jerao A, Ginn M, Jones MEB, Berhane Y. 2023. Characterization of neurotropic HPAI H5N1 viruses with novel genome constellations and mammalian adaptive mutations in free-living mesocarnivores in Canada. Emerging Microbes & Infections. Emerging Microbes and Infections 12(1):2186608. https://doi.org/10.1080/22221751.2023.2186608 (en anglais seulement)
  • Berhane Y, Joseph T, Lung O, Embury-Hyatt C, Xu W, Cottrell P, Raverty S. 2022. Isolation and Characterization of Novel Reassortant Influenza A(H10N7) Virus in a Harbor Seal, British Columbia, Canada. Infectious Diseases 28(7):1480-1484. https://doi.org/10.3201/eid2807.212302 (en anglais seulement)
  • Caliendo V, Lewis NS, Pohlmann A, Baillie SR, Banyard AC, Beer M, Brown IH, Fouchier RAM, Hansen RDE, Lameris TK, Lang AS, Laurendeau S, Lung O, Robertson G, van der Jeugd H, Alkie TN, Thorup K, van Toor ML, Waldenström J, Yason C, Kuiken T, Berhane Y. 2022. Transatlantic spread of highly pathogenic avian influenza H5N1 by wild birds from Europe to North America in 2021. Scientific Reports 12(1):11729. https://doi.org/10.1038/s41598-022-13447-z (en anglais seulement)
  • Fisher M, Nebroski M, Davies J, Janzen E, Sullivan D, Lung O. 2023. Discovery and comparative genomic analysis of a novel equine anellovirus, representing the first complete Mutorquevirus genome. Scientific Reports 13(3703):1-10. https://doi.org/10.1038/s41598-023-30875-7 (en anglais seulement)
  • Lung O, Fisher M, Nebroski M, McGregor G, Schwantje H, Joseph T. 2022. Whole-Genome Sequence of Cervid atadenovirus A from the Initial Cases of an Adenovirus Hemorrhagic Disease Epizootic of Black-Tailed Deer in Canada. Microbiology Resource Announcements 11(1):e0066222. https://doi.org/10.1128/mra.00662-22 (en anglais seulement)
  • Pickering B, Lung O, Maguire F, Kruczkiewicz P, Kotwa JD, Buchanan T, Gagnier M, Guthrie JL, Jardine CM, Marchand-Austin A, Massé A, McClinchey H, Nirmalarajah K, Aftanas P, Blais-Savoie J, Chee HY, Chien E, Yim W, Banete A, Griffin BD, Yip L, Goolia M, Suderman M, Pinette M, Smith G, Sullivan D, Rudar J, Vernygora O, Adey E, Nebroski M, Goyette G, Finzi A, Laroche G, Ariana A, Vahkal B, Côté M, McGeer AJ, Nituch L, Mubareka S, Bowman J. 2023. Divergent SARS-CoV-2 variant emerges in white-tailed deer with deer-to-human transmission. Nature Microbiology 8,188. https://doi.org/10.1038/s41564-022-01298-3 (en anglais seulement)
  • Stefani F, Beguin J, Paré D, Morency MJ, Martineau C, Fortin JA, Thiffault N, Séguin A. 2023. Does wood mulch trigger microbially mediated positive plant-soil feedback in degraded boreal forest sites? A post hoc study. Frontiers in Plant Science. Volume 14. https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1122445 (en anglais seulement)
  • Rabearison TJ, Poirier V, Gillespie A, Laganière J, DesRochers A. 2023. Increasing tree productivity does not translate into greater soil organic carbon storage. Forest Ecology and Management. Volume 535. https://doi.org/10.1016/j.foreco.2023.120884 (en anglais seulement)

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