Intégration de la génomique et de la modélisation dans un cadre unique pour éclairer l'évaluation future des risques d'importation et d'établissement des agents pathogènes émergents

Période de financement : 2023-2025
Responsable : Carmen Lia Murall
Financement total de l'IRDG : 909 900 $

Pour qu'elle puisse surveiller dans le monde et évaluer les risques d'importation et de propagation des nouveaux agents pathogènes et de leurs variants, l'Agence de la santé publique du Canada doit mieux exploiter les intrants dérivés de la génomique dans la modélisation, ce qui lui permettra de fournir plus efficacement des évaluations fondées sur des données probantes pour la prise de décisions. L'évaluation hâtive de la menace que présente un agent pathogène émergeant et les mesures d'atténuation subséquentes à mettre en œuvre sont de plus en plus axées sur les données. À mesure que les coûts diminuent et que l'expertise se développe, le recours au séquençage du génome entier prend de l'ampleur à l'échelle mondiale pour l'analyse et l'évaluation des agents pathogènes émergents et potentiellement pandémiques, comme les coronavirus, le virus de la grippe, le virus Ebola, etc. Pourtant, l'intégration de cette source de données dans la modélisation des risques d'importation et de propagation ne fait que commencer à se développer. Les méthodes génomiques d'évaluation des menaces, dont la phylodynamique et la phylogéographie, peuvent être utilisées pour déduire des paramètres importants sur le plan épidémiologique et pour évaluer la vitesse de croissance et les modèles de propagation géographique d'un agent pathogène émergent ou d'un variant. Le principal objectif de cette proposition est la mise au point de modèles validés de risques fondés sur la génomique et d'outils épidémiologiques génomiques qui peuvent être utilisés pour éclairer les interventions à mener de façon efficace en cas de futures menaces à la santé publique associées aux agents pathogènes.