Validation de matrices de fragments synthétiques d'ADN et d'ARN (gBlock) utilisées comme témoins positifs pour les essais diagnostiques phytosanitaires par qPCR

Période de financement : 2024

Responsable : Stephan Brière

Financement total de l'IRDG : 9 500 $

Le laboratoire de protection des végétaux et des semences de l'ACIA doit identifier plus de 10 000 agents phytopathogènes, mais il est impossible de conserver une telle collection vivante, surtout dans le cas des phytovirus. Cette réalité limite la capacité du laboratoire à réagir rapidement aux nouvelles menaces ou à certifier les exportations agricoles. Pour résoudre ce problème, le laboratoire utilise comme matrices pour la PCR des fragments synthétiques d'ADN et d'ARN (gBlocks), qui peuvent être rapidement synthétisés. Cette méthode est économique du point de vue financier et de celui de la main‑d'œuvre et fournit des témoins positifs fiables pour les tests PCR. Le laboratoire a réussi à créer et à valider des gBlocks pour deux phytovirus et prévoit en concevoir deux douzaines d'autres pour des champignons, des bactéries et des virus transmis par les semences, ce qui améliorera son efficacité et sa capacité de réponse.

Outil/processus de recherche

Mise à niveau des méthodes d'essai normalisées pour le virus du fruit rugueux brun de la tomate et du virus HPV (High Plains Virus) et création d'une nouvelle feuille de travail interne associée à une PON pour la préparation et l'utilisation des gBlocks (PP-WS030 Préparation de témoins pour techniques moléculaires). Les gBlocks validés ont été utilisés avec succès pour appuyer la certification des exportations de semences de tomates, de poivrons et de maïs.

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