Repousser les frontières avec la fonction microbienne : nouvelles percées sur le plan fonctionnel et métabolique relativement à l'évaluation des écosystèmes d'eau douce susceptibles d'être exposés à la contamination par des éléments nutritifs agricoles

Période de financement : 2020-2024
Responsables : Jordyn Broadbent et Thomas Reid
Investissement global de l'IRDG : 340 000 $

Le projet combine des approches métabolomiques et métatranscriptomiques nouvelles dans une approche conjointe destinée à évaluer les répercussions de la contamination par des éléments nutritifs agricoles dans le sud-ouest de l'Ontario. La zone de recherche est située sur le territoire traditionnel des Premières Nations de la Confédération des Trois feux, qui englobe les Ojibways, les Odawas et les Potawatomis. Mené en collaboration avec Agriculture et Agroalimentaire Canada (AAAC) et l'Université de Windsor, le projet vise à approfondir la compréhension de l'activité microbienne près des terres agricoles sur le plan spatiotemporel. Les expériences en laboratoire et sur le terrain examineront la faisabilité d'identification de marqueurs génétiques et métaboliques microbiens uniques en réponse à des contaminations aiguës ou chroniques. Le vaste ensemble de données obtenu fournira une gamme de nouveaux marqueurs fonctionnels qui pourront être utilisés pour évaluer et surveiller la contamination par des nutriments et il pourra être interrogé par divers utilisateurs finaux qui effectuent des recherches connexes (c.-à-d. liées aux marqueurs de pollution urbaine, à la résistance antimicrobienne dans l'environnement, etc.).

Publication

Reid T, Bergsveinson J. 2021. How do the players play? A post-genomic analysis paradigm to understand aquatic ecosystem processes. Front. Mol. Biosci. (8)395.  https://doi.org/10.3389/fmolb.2021.662888

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