Exploiter les phytobiomes pour atténuer les maladies des arbres forestiers : Le sapin de Douglas et la rouille suisse des aiguilles

Période de financement : 2020-2024
Responsable : Joey Tanney
Investissement global de l'IRDG : 179 220 $

Les principaux objectifs du projet comprennent les suivants : (1) déterminer les espèces ou les consortiums d'endophytes fongiques toxigènes/antagonistes associés à la réduction des symptômes de la rouille suisse des aiguilles chez le sapin Douglas; (2) isoler et caractériser les métabolites secondaires bioactifs produits par les souches d'endophytes; (3) élucider les mycobiomes des aiguilles du sapin de Douglas, notamment en générant des séquences de référence et en décrivant de nouveaux taxons, lorsque possible; (4) évaluer l'application de l'outil de séquençage Oxford Nanopore MinION pour la quantification en temps réel et à haut débit des communautés d'endophytes des aiguilles; et (5) établir un panel de souches d'endophytes candidates pour des essais d'inoculation en aval pour contrôler la rouille suisse des aiguilles. Les avantages socioéconomiques prévus comprennent l'amélioration des connaissances sur la rouille suisse des aiguilles, l'orientation des efforts d'amélioration des arbres de la Colombie-Britannique en vue d’augmenter la tolérance à la rouille suisse des aiguilles et la détermination de stratégies de gestion potentielles (par exemple, le contrôle biologique et la tolérance transférée horizontalement). Ces résultats permettront d'atténuer les effets économiques et environnementaux de cette maladie de plus en plus grave, qui réduit considérablement la croissance du sapin de Douglas et remet en cause les efforts de régénération.

Publication

  • Feau N, Tanney JB, Herath P, Leal I, Hamelin RC. 2024. Genome sequences of three genetic lineages of the fungus Nothophaeocryptopus gaeumannii, the causal agent of Swiss needle cast on Douglas-fir trees. Microbiol Resour Announc 13:e01008-23. https://doi.org/10.1128/mra.01008-23 (en anglais seulement)

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