Évaluation de développement d'une méthode de séparation magnétique propre à la listériose (CBD-MS) et d'une approche combinant la méthode CBD-MS et MDA pour le séquençage de la bactérie Listeria monocytogenes dans les aliments

Période de financement : 2021-2024
Responsable : Calvin Lau
Investissement global de l'IRDG : 125 000 $

Listeria monocytogenes est une importante bactérie pathogène d'origine alimentaire et le principal agent causal de la listériose. Afin d'atténuer le danger pour la salubrité des aliments, l'ACIA fait appel à des méthodes d'analyse microbiologique solides et sensibles pour effectuer des travaux réguliers d'inspection et de surveillance d'échantillons alimentaires à haut risque. À l'heure actuelle, la majorité des méthodes de référence approuvées par Santé Canada pour L. monocytogenes nécessitent de longues étapes d'enrichissement de culture. Dans le but de développer des outils qui peuvent facilement être utilisés par les analystes de laboratoire de première ligne comme méthodes parallèles ou de rechange pour accélérer l'identification et la détection, l'isolement et la caractérisation de L. monocytogenes, on examinera une approche axée sur la cible destinée à récupérer plus efficacement le microorganisme d'origine alimentaire et son contenu génomique. Le projet vise à développer et à évaluer une autre méthode de séparation magnétique non fondée sur l'utilisation d'anticorps, c'est-à-dire la méthode CBD-MS. Ainsi , il sera possible d'effectuer le prélèvement sélectif de cellules de L. monocytogenes à partir d'échantillons alimentaires qui subissent des procédures d'enrichissement de culture dans le cadre de la méthode MFHPB-30. Un flux de travaux novateur combinant ce qui suit : i) l'enrichissement sélectif axé sur la culture; ii) l'immobilisation de cibles à forte affinité et le prélèvement à l'aide de la méthode CBD-MS et iii) l'amplification du génome dans un seul tube par amplification isotherme à déplacements multiples (MDA), sera également développé. Le flux de travaux en question devrait produire suffisamment de matériel génomique de L. monocytogenes à partir d'échantillons partiellement ou entièrement enrichis pour permettre un séquençage à haut débit et un contrôle rapide par réaction de polymérisation en chaîne (PCR)/PCR quantitative. Cela favorisera un délai de traitement plus court pour l'identification des souches et l'établissement de correspondances avec des isolats liés à une éclosion ou des isolats cliniques.