Études d'association pangénomique pour une sélection génomique destinée à améliorer la tolérance à la sécheresse du sapin de Douglas

Période de financement : 2020-2024
Responsable : Jun-Jun Liu et Isabel Leal
Investissement global de l'IRDG : 179 220 $

Le projet vise à réaliser une étude d'association pangénomique classique par génotypage de polymorphisme mononucléotidique (single-nucleotide polymorphism — SNP) de 1 152 arbres à l'aide d'un essai par puce à ADN du sapin de Douglas en accès libre développé par CoAdapTree à l'Université de la Colombie-Britannique et produit par Thermo Fisher. La puce à ADN contient de 20 000 à 30 000 SNP adaptatifs associés à des variables climatiques, à la résistance à la sécheresse, à la rusticité et à la rouille suisse des aiguilles, ainsi qu'environ 1 000 à 5 000 SNP neutres qui permettent d'estimer la structure de la population. Ces SNP détectés dans les populations sauvages et validés dans la population reproductrice fourniront une base pour génotyper des milliers de locus différents à la fois, afin de déterminer les associations entre les phénotypes quantitatifs et la variation génétique sous-jacente dans les populations reproductrices de la Colombie-Britannique. Le projet vise également à réaliser des analyses complètes de la filiation par génotypage pour reconstituer la généalogie complète. Les sélectionneurs provinciaux pourront utiliser les résultats de ce travail pour déterminer des génotypes d'élite qui présentent des caractères relatifs à l'adaptation à la sécheresse dans le contexte des changements climatiques, à la productivité et à la qualité du bois.