Période de financement : 2020-2024
Responsable : Christine Martineau
Investissement global de l'IRDG : 374 410 $
Les communautés microbiennes dans les sols exécutent une multitude de processus qui sous-tendent d'importantes fonctions écologiques telles que la fertilité des sols et la régulation du climat. De même, les microorganismes présents dans l'eau sont un déterminant vital de la qualité de l'eau et des réseaux trophiques qui soutiennent les écosystèmes aquatiques. Malgré leurs rôles écologiques fondamentaux, les fonctions de la plupart des taxons microbiens restent méconnues, car ils ne peuvent pas être cultivés dans des conditions de laboratoire. L'objectif de la trousse de métagénomique est de développer des outils qui permettront la caractérisation taxonomique et fonctionnelle des communautés microbiennes dans le sol et l'eau. Les deux principales approches en cours d'élaboration sont la métagénomique par séquençage aléatoire et la métatranscriptomique. Les outils permettront d'évaluer et de protéger les fonctions microbiennes dans les écosystèmes forestiers et conduiront à l'élaboration de solutions de résilience des forêts basées sur les connaissances, contribuant ainsi à la performance environnementale du secteur forestier. En tant que validation de principe, le projet conduira à la détermination de solutions afin de maintenir ou d'augmenter le stockage de carbone dans les sols des forêts boréales, ce qui pourrait avoir des répercussions environnementales et économiques.
Publications
- Auer L, Buée M, Fauchery L, Lombard V, Barry KW, Clum A, Copeland A, Daum C, Foster B, LaButti K, Singan V, Yoshinaga Y, Martineau C, Alfaro M, Castillo FJ, Imbert JB, Ramírez L, Castanera R, Pisabarro AG, Finlay R, Lindahl B, Olson A, Séguin A, Kohler A, Henrissat B, Grigoriev IV, Martin FM. 2023. Metatranscriptomics sheds light on the links between the functional traits of fungal guilds and ecological processes in forest soil ecosystems. New Phytol n/a(n/a). https://doi.org/10.1111/nph.19471 (en anglais seulement)
- Freeman EC, Emilson EJS, Dittmar T, Braga LPP, Emilson CE, Goldhammer T, Martineau C, Singer G, Tanentzap AJ. 2024. Universal microbial reworking of dissolved organic matter along environmental gradients. Nat Commun 15(1):187. https://doi.org/10.1038/s41467-023-44431-4 (en anglais seulement)
- Gao L, Paré D, Martineau C, Yin X, Rodríguez-Rodríguez JC, Gagné P, Bergeron Y. 2024. Response of the soil microbial communities to forest ground cover manipulation in a boreal forest. For Ecol Manag 553:121615. https://doi.org/10.1016/j.foreco.2023.121615 (en anglais seulement)
- Samad A, Degenhardt D, Séguin A, Morency M-J, Gagné P, Martineau C. 2023. Microbial community structural and functional differentiation in capped thickened oil sands tailings planted with native boreal species. Front Microbiol 14 https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1168653 (en anglais seulement)
- Taylor RS, Manseau M, Redquest B, Keobouasone S, Gagné P, Martineau C, Wilson PJ. 2021. Whole genome sequences from non-invasively collected caribou faecal samples. Conservation Genet Resour. 14: 53-68. https://doi.org/10.1007/s12686-021-01235-2 (en anglais seulement)
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