Dépôt national de séquences d'ADN de référence pour les poissons marins et les invertébrés du Canada

Période de financement : 2023-2025

Responsable : Kristen Westfall

Financement total de l'IRDG : 90 200 $

Le suivi de la biodiversité est un principe fondamental de la gestion de la conservation et des engagements du Canada en matière de conservation. Le Canada a établi une série de lignes directrices sur les « meilleures pratiques » pour les aires marines protégées (AMP), qui mettent l'accent sur la nécessité d'utiliser des méthodes d'étude non destructives et à espèces multiples. Le métabarcodage de l'ADN environnemental révolutionne le domaine de la biosurveillance. De nombreuses études menées au Canada indiquent qu'il s'agit d'une solution viable et non destructive pour la surveillance de la biodiversité dans les AMP.

Ce projet permettra de créer un dépôt national de séquences d'ADN de référence pour les poissons marins et les invertébrés en établissant 2 éléments fondamentaux essentiels : (1) un dépôt permanent de séquences d'ADN de référence sur le Web, et (2) un ensemble de lignes directrices qui établissent des normes minimales de déclaration pour les séquences de référence, un modèle de soumission pour le dépôt, et un pipeline bio-informatique reproductible automatisé pour garantir les principes des données facilement accessibles, interopérables et réutilisables (FAIR). Le dépôt sera alimenté par 300 séquences de référence du génome mitochondrial d'espèces hautement prioritaires, ce qui aura une incidence immédiate sur de multiples programmes du MPO.