Amélioration et mise à l’échelle de l’application bio-informatique Web de diagnostic Virtool pour le domaine de la santé des animaux et des végétaux

Période de financement : 2020-2023
Responsables : Ian Boyes et Mike Rott
Investissement global de l'IRDG : 229 000 $

Le séquençage à haut débit permet de détecter et de caractériser rapidement et précisément les agents pathogènes, en utilisant des systèmes logiciels spécialisés pour la gestion et l'analyse des données. L'ACIA a développé Virtool (www.virtool.ca), une application Web qui permet de gérer, de suivre et d'analyser les données de séquençage à haut débit. L'objectif principal de l'application Virtool est de détecter les virus et les viroïdes dans les plantes qui revêtent une importance commerciale. L'application est conçue pour les diagnosticiens qui ne sont pas familiers avec les logiciels à lignes de commande, mais qui sont à l'aise avec les interfaces Web modernes. Elle prend en charge les protocoles mis au point par l'ACIA et est conforme aux normes internationales d'essais en laboratoire, à savoir la norme ISO 17025 de l'Organisation internationale de normalisation (ISO). Pour répondre à ces exigences, l'application Virtool permet de réaliser une vérification approfondie de l'activité des utilisateurs, de protéger par mot de passe l'accès des utilisateurs et de contrôler les autorisations et d'assurer la gestion des versions et le suivi des modifications apportées aux bases de données de référence et offre des flux de travaux éprouvés et prévisibles. Le projet vise à transformer Virtool en une application native en nuage qui peut desservir un large public.